Un cocktail de phages pour combattre les infections urinaires

La thérapie de Locus est en réalité un cocktail de six phages. La société a utilisé l’intelligence artificielle pour prédire une combinaison qui serait efficace contre E. coli. Trois des phages sont « lytiques », c’est-à-dire qu’ils fonctionnent en infectant les cellules d’E. coli et en les faisant éclater. Les trois autres sont conçus pour contenir Crispr afin d’améliorer leur efficacité. Une fois à l’intérieur de leurs cellules cibles, ces phages utilisent le système Crispr pour cibler un site crucial dans le génome d’E. coli et commencer à dégrader l’ADN de la bactérie.

Certaines phages sont très efficaces pour pénétrer dans les cellules bactériennes mais moins efficaces pour les tuer. « C’est là que l’édition génique intervient », explique Paul Garofolo, PDG de Locus. Il affirme que la thérapie vise à « atteindre le corps humain et éliminer une espèce bactérienne ciblée sans toucher à rien d’autre ».

Dans le cadre d’un essai de phase 2, 16 femmes ont reçu un traitement de trois jours avec le cocktail de phages, ainsi que du Bactrim, un antibiotique couramment prescrit pour les infections urinaires. Dans les quatre heures suivant le premier traitement, les niveaux d’E. coli dans l’urine ont rapidement diminué et sont restés stables jusqu’à la fin de la période d’étude de 10 jours. À ce moment-là, les symptômes de l’infection urinaire chez toutes les participantes avaient disparu, et les niveaux d’E. coli étaient suffisamment bas chez 14 des 16 femmes pour être considérées comme guéries.

Ces résultats ont été rapportés le 9 août dans la revue « The Lancet Infectious Diseases ». L’Autorité de recherche et de développement avancée en biotechnologie, ou BARDA, une partie du Département de la Santé et des Services Sociaux des États-Unis, participe au développement de la thérapie.

Les infections urinaires sont incroyablement courantes, et environ la moitié des femmes en auront une au cours de leur vie. Plus de 80 % des infections sont causées par E. coli, et dans un rapport de 2022, l’Organisation Mondiale de la Santé a constaté qu’une infection urinaire sur cinq causée par E. coli montrait une sensibilité réduite aux antibiotiques standard tels que l’ampicilline, la co-trimoxazole et les fluoroquinolones.

Bien que la thérapie par phages soit courante en République de Géorgie et en Pologne, elle n’est pas autorisée aux États-Unis. Cependant, elle est utilisée de manière expérimentale dans certains cas avec l’autorisation de la Food and Drug Administration des États-Unis. Un défi majeur pour la commercialisation de la thérapie par phages est qu’elle est souvent personnalisée pour chaque patient et donc difficile à mettre à l’échelle. Trouver le bon phage pour le traitement peut prendre du temps, puis des lots de phages doivent être cultivés et purifiés. Mais l’utilisation d’un cocktail fixe comme celui de Locus permettrait de faciliter la mise à l’échelle de la thérapie.

Il y a un autre avantage potentiel. « Les phages améliorés par Crispr permettent la dégradation du génome bactérien et pourraient contourner plusieurs mécanismes par lesquels les bactéries peuvent devenir résistantes aux phages », explique Saima Aslam, professeure de médecine à l’Université de Californie, San Diego, qui étudie les phages mais ne participe pas au développement de la thérapie de Locus. « Théoriquement, cela pourrait empêcher la reprise de bactéries résistantes aux phages et donc conduire à un traitement plus efficace. »

Source : Crispr-Enhanced Viruses Are Being Deployed Against UTIs